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关键词

医学 5

抗生素 5

代谢与免疫 2

信息素 2

剖宫产瘢痕妊娠 2

吸附 2

1T/2H-MoS2 1

ABC-F家族蛋白 1

BPA 1

CD44 1

CGCS2000维持 1

Epianastrephin 1

GDP年增长率 1

Grade 91钢 1

HSLC钢 1

MS-CETSA 1

PVC引诱剂 1

RE- cmeABC 1

REC114 1

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农田土壤抗生污染管控建议

王娜,郭欣妍,单正军,蔡道基

《中国工程科学》 2021年 第23卷 第1期   页码 167-173 doi: 10.15302/J-SSCAE-2021.01.023

摘要:

抗生在畜禽养殖业中发挥了重要保障作用,但畜禽粪便农用后伴生的抗生耐药传播风险日益显现,农田土壤抗生及其耐药基因的风险管控工作亟待开展本文总结了农田土壤中抗生的污染现状,梳理了农田土壤中新兴污染物抗生管控存在的问题,提出了农田土壤抗生及其耐药基因的风险管控建议。研究发现,农田土壤抗生及其耐药基因的污染风险不可忽视,但抗生类新兴污染物尚未纳入土壤风险管控范围内。应设立严格的兽药应用监管机制,从养殖源头扼制风险的发生概率;制定有机肥中反映耐药的控制标准,出台技术指南以规范含抗生粪便的处置与施用,减少抗生耐药基因进入环境的总量。同时加紧开展环境抗生耐药产生和转移的人类健康风险评估研究,实施农田土壤环境抗生耐药常规监测,发挥风险评估在该类污染物风险管控工作中的作用。

关键词: 抗生     耐药基因     农田土壤     传播风险     管控对策    

2018—2019年我国北方地区奶牛临床型乳房炎源肺炎克雷伯菌的分子特征 Article

宋士凯, 何文娟, 杨大伟, Manar Benmouffok, 王瑶, 李基云, 孙城涛, 宋祥彬, 马士珍, 蔡畅, 丁双阳, 吴聪明, 沈张奇, 汪洋

《工程(英文)》 2022年 第10卷 第3期   页码 146-154 doi: 10.1016/j.eng.2021.01.015

摘要: KpI 菌株比KpII-B 和KpIII 菌株表现出更高的流行率以及抗生耐药基因和毒力基因携带率,表明它可能对奶牛的危害更大。

关键词: 临床型乳房炎     肺炎克雷伯菌     分子特征     种群结构     抗生耐药    

越南广平和顺化两省猪场分离副猪嗜血杆菌的抗生耐药表型和耐药基因之间的相关性研究 Article

Chao Nguyen Van, 张丽君, Tam Vu Thi Thanh, Hung Pham Hoang Son, Tuan Tran Ngoc, 黄琦, 周锐

《工程(英文)》 2020年 第6卷 第1期   页码 40-48 doi: 10.1016/j.eng.2019.10.014

摘要: 副猪嗜血杆菌防控失败的原因之一是细菌耐药不断加重。越南拥有亚洲排名第二的生猪产量,但是缺乏针对副猪嗜血杆菌耐药的相关研究和数据。本研究的目的是调查越南副猪嗜血杆菌的耐药,并分析耐药耐药基因之间的关系。本研究所使用的副猪嗜血杆菌分离菌株来自我们之前研究中从越南广平省和顺化省猪场分离到的菌株。本研究分别利用肉汤微稀释法和聚合酶链反应(PCR)法检测了这些菌株对25种抗生耐药及相关耐药基因的存在情况。头孢呋辛、氯霉素和妥布霉素的耐药表型分别与耐药基因blaROB-1 [优势比(OR) = 26.3, 95% 置信区间(CI)2.7~255.7, p = 0.002]、catl (本研究首次揭示了越南中部地区副猪嗜血杆菌的耐药情况,有助于该疾病的临床控制,能够为降低越南中部的养猪业中该菌的耐药以及为相关政策制定和临床用药提供指导。

关键词: 副猪嗜血杆菌,抗药性耐药基因,越南    

我国细菌耐药问题的现状和防控策略

夏照帆,吕开阳,汤陈琪,李骏强

《中国工程科学》 2017年 第19卷 第2期   页码 106-111 doi: 10.15302/J-SSCAE-2017.02.018

摘要:

细菌耐药危机日趋严峻,已经成为全球范围内的重大公共安全问题,严重危害人类、动物的健康和生态环境。本文总结了我国各领域细菌耐药问题的现状,分析了加剧细菌耐药的直接原因,揭示了细菌耐药问题对国民健康、食品安全、生态环境、经济发展等可能造成的危害,整理了我国目前开展的防控行动以及取得的主要成果,最后针对我国细菌耐药防控在耐药监测、抗生监管、危害风险评估、人才队伍建设等方面的不足,提出了多领域合作、多部门联防联控的细菌耐药防控策略。

关键词: 细菌耐药     抗生     可持续发展     防控策略    

细菌耐药威胁人类健康 Editorial

沈建忠, Timothy R. Walsh

《工程(英文)》 2022年 第15卷 第8期   页码 1-2 doi: 10.1016/j.eng.2022.06.003

应对可转移多黏菌素耐药——饲料添加剂来源的白屈菜红碱具有双重效应 Article

宋黄威, 王雪杨, 张慕琛, 邹之宇, 杨思源, 易甜, 王建峰, 刘德俊, 沈应博, 代重山, 刘志海, Timothy R. Walsh, 沈建忠, 吴聪明, 汪洋

《工程(英文)》 2024年 第32卷 第1期   页码 163-173 doi: 10.1016/j.eng.2023.06.012

摘要:

可转移多黏菌素耐药基因mcr-1及其变异体的出现、蔓延严重威胁了多黏菌素作为临床治疗多重耐药革兰阴性菌感染最后一道防线药物的药效寻找抗生佐剂是恢复多黏菌素对其耐药菌敏感性的有效策略。然而,鲜有研究探索抗生佐剂对多黏菌素耐药基因传播的影响。PMF),产生活性氧(reactive oxygen species, ROS),造成细菌胞内ATP耗竭,下调了mcr-1及接合转移相关基因的转录水平,从而实现既能增强多黏菌素对抗耐药菌作用,又能抑制耐药质粒接合转移的双重作用。白屈菜红碱的双重作用拓展了抗生佐剂的应用范围,并提供了应对多黏菌素耐药的新思路。

关键词: 白屈菜红碱     抗生佐剂     接合转移抑制剂     多黏菌素     双重作用    

微生物耐药在人与动物间的传播——我们为什么需要知道更多? Views & Comments

Julian Parkhill

《工程(英文)》 2022年 第15卷 第8期   页码 11-12 doi: 10.1016/j.eng.2022.04.007

猪链球菌中发现可介导链阳菌素A、截短侧耳类以及林可酰胺类药物耐药的新型耐药基因 srpA Article

张朝阳, 刘璐, 张朋, 崔箐坡, 秦晓霞, 马立超, 韩坤, 王战辉, 王少林, 丁双阳, 沈张奇

《工程(英文)》 2022年 第9卷 第2期   页码 85-94 doi: 10.1016/j.eng.2020.12.015

摘要:

细菌耐药问题毫无疑问是全球最大的健康威胁之一。耐甲氧西林的金黄色葡萄球菌、耐万古霉素的屎肠球菌和耐β-内酰胺的肺炎链球菌等多重耐药革兰氏阳性菌的出现,严重限制了临床可用的抗菌药物。截短侧耳类、恶唑烷酮类以及链阳霉素类等许多靶向核糖体的抗菌药物,有望成为治疗这些多重耐药病原体的替代选择。本研究中,我们通过比较基因组学,在截短侧耳耐药猪链球菌中发现了一个新型耐药基因srpA。功能克隆试验显示该基因可以介导猪链球菌和金黄色葡萄球菌等对截短侧耳类、林可酰胺类和链阳菌素A类抗菌药物的交叉耐药。分子对接试验显示SrpA 的loop 区域与肽基转移酶中心的截短侧耳类结合口袋重合,并与截短侧耳类竞争结合该位点。进一步研究发现SrpA 中loop 区的氨基酸突变或缺失将不同程度地影响细菌的耐药,证实该结构域对SrpA 功能至关重要。

关键词: SrpA     猪链球菌     耐药     核糖体     ABC-F家族蛋白    

头孢他啶-阿维巴坦耐药革兰氏阴性菌的流行病学特征及耐药机制 Review

徐婷婷, 郭育奇, 姬扬, 王保红, 周凯

《工程(英文)》 2022年 第11卷 第4期   页码 138-145 doi: 10.1016/j.eng.2020.11.004

摘要:

细菌的碳青霉烯耐药是全球公共健康面临的一个重大挑战,由碳青霉烯耐药菌(CRO)引起的临床感染通常有很高的发病率和死亡率。然而,这种药物在临床使用后不久,细菌的耐药就已经出现,并且呈上升趋势。了解细菌对CAZ-AVI 的耐药机制,对于指导开发新型治疗方法、帮助预测潜在的耐药机制至关重要。本文旨在系统总结CAZ-AVI 耐药菌株的流行病学发展过程和最近发现的CAZ-AVI 耐药机制;将重点关注β-内酰胺酶突变体的产生、β-内酰胺酶高表达、细胞表面通透性降低以及药物外排泵的过表达短时间内多种CAZ-AVI耐药机制的产生,强调了临床合理用药的重要性以及监测CAZ-AVI 耐药病原体的必要性。

关键词: 头孢他啶-阿维巴坦     耐药机制     碳青霉烯耐药     β-内酰胺/β-内酰胺酶抑制剂    

ARGs-OAP v3.0——抗生耐药基因数据库的筛选和分析流程优化 Article

Xiaole Yin, Xiawan Zheng, Liguan Li, An-Ni Zhang, Xiao-Tao Jiang, Tong Zhang

《工程(英文)》 2023年 第27卷 第8期   页码 234-241 doi: 10.1016/j.eng.2022.10.011

摘要:

Antibiotic resistance, which is encoded by antibiotic-resistance genes (ARGs), has proliferated to become a growing threat to public health around the world. With technical advances, especially in the popularization of metagenomic sequencing, scientists have gained the ability to decipher the profiles of ARGs in diverse samples with high accuracy at an accelerated speed. To analyze thousands of ARGs in a highthroughput way, standardized and integrated pipelines are needed. The new version (v3.0) of the widely used ARGs online analysis pipeline (ARGs-OAP) has made significant improvements to both the reference database—the structured ARGs (SARG) database—and the integrated analysis pipeline. SARG has been enhanced with sequence curation to improve annotation reliability, incorporate emerging resistance genotypes, and determine rigorous mechanism classification. The database has been further organized and visualized online in the format of a tree-like structure with a dictionary. It has also been divided into sub-databases for different application scenarios. In addition, the ARGs-OAP has been improved with adjusted quantification methods, simplified tool implementation, and multiple functions with userdefined reference databases. Moreover, the online platform now provides a diverse biostatistical analysis workflow with visualization packages for the efficient interpretation of ARG profiles. The ARGs-OAP v3.0 with an improved database and analysis pipeline will benefit academia, governmental management, and consultation regarding risk assessment of the environmental prevalence of ARGs.

关键词: SARG database ARGs-OAP     Antibiotic-resistance genes     Environmental metagenome     Quantification    

基于同一健康策略探究老挝人、动物和环境中多黏菌素耐药的传播特征 Article

周宇晴, Refath Farzana, Somsavanh Sihalath, Sayaphet Rattanavong, Manivanh Vongsouvath, Mayfong Mayxay, Kirsty Sands, Paul N. Newton, David A.B. Dance, Brekhna Hassan, Timothy R. Walsh

《工程(英文)》 2022年 第15卷 第8期   页码 45-56 doi: 10.1016/j.eng.2022.01.013

摘要:

This study was designed to investigate the molecular epidemiology of mobile colistin resistance (mcr) using a "One-Health" approach in Laos and to predict whether any dominant plasmid backbone and/or strain type influences the dissemination of mcr. We collected 673 samples from humans (rectal normal flora), poultry, and the environment (water, flies, birds, etc.) in Vientiane, Lao People's Democratic Republic (Laos), from May to September 2018. A total of 238 Escherichia coli (E. coli) isolated from nonduplicative samples, consisting of 98 MCR-positive E. coli (MCRPEC) ("mcr" denotes the gene encoding mobile colistin resistance, and "MCR" denotes the subsequent protein encoded by mcr) and 140 MCRnegative E. coli (MCRNEC), were characterized by phenotype and Illumina sequencing. A subset of MCRPEC was selected for MinION sequencing, conjugation assay, plasmid stability, and growth kinetics in vitro. The prevalence of MCRPEC was found to be 14.6% (98/673), with the highest prevalence in human rectal swabs (45.9% (45/98), p < 0.0001, odds ratio (OR): 0.125, 95% confidence interval (CI): 0.077–0.202). The percentages of MCRPEC from other samples were 14.3% (2/14) in dog feces, 12.0% (24/200) in flies, 11.0% (11/100) in chicken meat, 8.9% (8/90) in chicken cloacal, 8.0% (4/50) in chicken caeca, and 7.5% (4/53) in wastewater. MCRPEC was significantly more resistant to co-amoxiclav, sulfamethoxazoletrimethoprim, levofloxacin, ciprofloxacin, and gentamicin than MCRNEC (p < 0.05). Genomic analysis revealed the distribution of MCRPEC among diverse clonal types. The putative plasmid Inc types associated with mcr-1 were IncX4, IncHI2, IncP1, IncI2, and IncFIA, and those associated with mcr-3 were IncFII, IncFIA, IncFIB, IncP1, and IncR. Recovery of highly similar plasmids from both flies and other sampling sectors implied the role of flies in the dissemination of mcr-1. mcr-positive plasmids were shown to be conjugative, and a significantly high transfer rate into a hypervirulent clone ST1193 was observed. Plasmids containing mcr irrespective of Inc type were highly stable and invariably did not exert a fitness effect upon introduction into a new host. These findings signify the urgent need for a standard infection control program to radically decontaminate the source of resistance.

关键词: 多黏菌素耐药     mcr     大肠杆菌     老挝     水平传播    

红霉素发酵菌渣长期施用对土壤耐药基因的累积影响 Article

韩子铭, 冯皓迪, 栾晓, 沈云鹏, 任立人, 邓留杰, D.G. Joakim Larsson, Michael Gillings, 张昱, 杨敏​​​​​​​

《工程(英文)》 2022年 第15卷 第8期   页码 78-88 doi: 10.1016/j.eng.2022.05.011

摘要:

抗生发酵生产过程产生的富含有机质的发酵菌渣具有资源化的潜力,但残留的高浓度抗生限制了其资源化利用。土壤宏基因组测序发现,农业常规剂量施用对土壤耐药基因影响较弱,但极端高剂量施用对土壤耐药基因产生累积影响。具体而言,土壤耐药基因丰度和多样性没有受到单次(第一年)施用的影响,但在第二年和第三年期间逐渐发生变化,大环内酯类耐药基因被选择性富集。土壤细菌群落和可移动遗传元件的变化趋势与耐药基因相似,相关性分析和结构方程模型均表明三年期间红霉素、细菌群落、可移动遗传元件与耐药基因的关联性逐渐增强。本研究揭示了亚抑制水平红霉素长期暴露对土壤耐药基因产生累积影响的机制,菌渣中抗生的高效去除和菌渣环境耐药影响的长期评价对未来菌渣安全处置与资源化利用至关重要。

关键词: 制药工业     耐药基因组     抗生     风险评估     修复     土壤施用    

用于环境催化的MoS2/ZIF-8复合材料——太阳能驱动的抗生降解工程 Article

陈文倩, 李琳悦, 李林, 裘文慧, 唐量, 徐玲, 许科军, 吴明红

《工程(英文)》 2019年 第5卷 第4期   页码 755-767 doi: 10.1016/j.eng.2019.02.003

摘要: 在本文中,我们提供了一种MoS2/ZIF-8复合光催化剂,它可以使环丙沙星(CIP)和盐酸四环(TC)的光催化降解率分别达到1T/2H-MoS2的1.21倍和因此,1T/2H-MoS2/MOF基光催化剂具有良好的抗生降解工程应用前景。

关键词: 1T/2H-MoS2     ZIF-8     抗生降解     光催化    

“细菌耐药形成及防控策略国际高端论坛暨第一届细菌耐药青年学术论坛”在桐乡举行

会议日期: 2021年11月16日

会议地点: 中国

主办单位: 中国工程院

标题 作者 时间 类型 操作

农田土壤抗生污染管控建议

王娜,郭欣妍,单正军,蔡道基

期刊论文

2018—2019年我国北方地区奶牛临床型乳房炎源肺炎克雷伯菌的分子特征

宋士凯, 何文娟, 杨大伟, Manar Benmouffok, 王瑶, 李基云, 孙城涛, 宋祥彬, 马士珍, 蔡畅, 丁双阳, 吴聪明, 沈张奇, 汪洋

期刊论文

越南广平和顺化两省猪场分离副猪嗜血杆菌的抗生耐药表型和耐药基因之间的相关性研究

Chao Nguyen Van, 张丽君, Tam Vu Thi Thanh, Hung Pham Hoang Son, Tuan Tran Ngoc, 黄琦, 周锐

期刊论文

我国细菌耐药问题的现状和防控策略

夏照帆,吕开阳,汤陈琪,李骏强

期刊论文

细菌耐药威胁人类健康

沈建忠, Timothy R. Walsh

期刊论文

张昱:抗生发酵废水和菌渣的环境耐药传播风险与阻断(2022年8月31日)

2022年10月17日

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应对可转移多黏菌素耐药——饲料添加剂来源的白屈菜红碱具有双重效应

宋黄威, 王雪杨, 张慕琛, 邹之宇, 杨思源, 易甜, 王建峰, 刘德俊, 沈应博, 代重山, 刘志海, Timothy R. Walsh, 沈建忠, 吴聪明, 汪洋

期刊论文

微生物耐药在人与动物间的传播——我们为什么需要知道更多?

Julian Parkhill

期刊论文

猪链球菌中发现可介导链阳菌素A、截短侧耳类以及林可酰胺类药物耐药的新型耐药基因 srpA

张朝阳, 刘璐, 张朋, 崔箐坡, 秦晓霞, 马立超, 韩坤, 王战辉, 王少林, 丁双阳, 沈张奇

期刊论文

头孢他啶-阿维巴坦耐药革兰氏阴性菌的流行病学特征及耐药机制

徐婷婷, 郭育奇, 姬扬, 王保红, 周凯

期刊论文

ARGs-OAP v3.0——抗生耐药基因数据库的筛选和分析流程优化

Xiaole Yin, Xiawan Zheng, Liguan Li, An-Ni Zhang, Xiao-Tao Jiang, Tong Zhang

期刊论文

基于同一健康策略探究老挝人、动物和环境中多黏菌素耐药的传播特征

周宇晴, Refath Farzana, Somsavanh Sihalath, Sayaphet Rattanavong, Manivanh Vongsouvath, Mayfong Mayxay, Kirsty Sands, Paul N. Newton, David A.B. Dance, Brekhna Hassan, Timothy R. Walsh

期刊论文

红霉素发酵菌渣长期施用对土壤耐药基因的累积影响

韩子铭, 冯皓迪, 栾晓, 沈云鹏, 任立人, 邓留杰, D.G. Joakim Larsson, Michael Gillings, 张昱, 杨敏​​​​​​​

期刊论文

用于环境催化的MoS2/ZIF-8复合材料——太阳能驱动的抗生降解工程

陈文倩, 李琳悦, 李林, 裘文慧, 唐量, 徐玲, 许科军, 吴明红

期刊论文

“细菌耐药形成及防控策略国际高端论坛暨第一届细菌耐药青年学术论坛”在桐乡举行

2021年11月16日

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